1980年7月,於本院第14次院士會議中,周元燊、刁錦寰、李景均等21位院士聯名建議設立「統計學研究所」,經會議決議通過,復提報第10 屆評議會同意,並奉總統1981年2月19日批准。嗣經聘請周元燊院士等13位先生組成設所諮詢委員會,周院士為主任委員,於1982年7月1日成 立籌備處,趙民德博士為籌備處主任。至1987年8月,籌備處已具規模,奉准成所,同時將名稱改為現行之「統計科學研究所」,由趙民德博士 任第1、2任所長。之後,魏慶榮博士擔任第3、4任所長(自1993年8月至1999年8月),陳珍信博士擔任第5任所長(自1999年8月至2002年12 月),鄭清水博士擔任第6任所長(自2003年1月至2005年12月),林國棟博士擔任代理所長(自2006年1月至6月),李克昭博士擔任第7、8 任所長(自2006年7月至2012年7月),陳珍信博士擔任代理所長(自2012年7月至2013年7月),鄭清水博士擔任第9任所長(自2013年7月至 2016年6月),丘政民博士擔任代理所長(自2016年7月至2017年7月),陳君厚博士擔任第10、11任所長(自2017年7月至2023年7月),楊欣洲博士於2023年7月擔任第12任所長迄今。
本所持續從事統計科學基礎與應用研究,一方面尊重個人獨立研究,一方面積極加強所內外合作研究群的建立,以推動跨領域、跨院際的研究計畫。 本所目前有32位研究人員、21位博士後研究人員以及48位研究助理,行政及資訊支援團隊約21人,研究領域涵蓋:
本所研究成果多發表在重要的國際學術期刊,研究人員也經常主辦和參與國際學術會議,進行學術交流。近3年本所共有326餘篇文章發表於SCI期刊上。本所出版的《中華統計學誌》,為國際主要統計期刊之一。